Proteine implicate în scleroza laterală amiotrofică și demență influențează mecanismele de corectare a erorilor din ADN

Proteine implicate în scleroza laterală amiotrofică și demență influențează mecanismele de corectare a erorilor din ADN

©

Autor:

Proteine implicate în scleroza laterală amiotrofică și demență influențează mecanismele de corectare a erorilor din ADN

Un studiu realizat la Houston Methodist Research Institute È™i publicat în Nucleic Acids Research în septembrie 2025 a analizat relaÈ›ia dintre proteina TDP43 È™i expresia genelor implicate în repararea erorilor de potrivire a ADN-ului (MMR) în culturi celulare, modele animale È™i È›esut neuronal uman. Cercetarea arată că TDP43 are un rol esenÈ›ial în menÈ›inerea echilibrului expresiei acestor gene, cu implicaÈ›ii importante atât pentru neurodegenerare, cât È™i pentru cancer.
Proteina TDP43, un regulator nuclear al expresiei genice, are roluri complexe în procesarea ARN-ului, stabilitatea transcrierilor È™i controlul transportului acestora. Dereglarea funcÈ›iei TDP43 este un element central în patogeneza sclerozei laterale amiotrofice È™i a altor boli neurodegenerative. În paralel, sistemul de reparare a nepotrivirilor ADN (MMR) reprezintă un mecanism critic ce menÈ›ine fidelitatea replicării genomice, iar dezechilibrele sale sunt asociate cu tumori, rezistență la chimioterapie È™i procese mutagene în È›esuturile nervoase. InteracÈ›iunea dintre TDP43 È™i MMR nu fusese însă clar caracterizată, deÈ™i ambele sisteme sunt implicate în menÈ›inerea stabilității genomice È™i în declanÈ™area răspunsului la deteriorarea ADN-ului.

Despre studiu

Structura experimentală

Studiul a utilizat o abordare integrată care a combinat:

  • culturi celulare umane HEK293, SH-SY5Y È™i celule stem pluripotente induse, diferenÈ›iate în neuroni;
  • modele animale murine care exprimă TDP43 mutant sau supraprodus;
  • analiza È›esuturilor cerebrale post-mortem de la pacienÈ›i cu ALS-Parkinsonian din Guam;
  • analize transcriptomice extinse bazate pe baza de date TCGA.

Analize moleculare

Autorii au evaluat în mod detaliat:

  • expresia genelor MMR (MLH1, MSH2, MSH3, MSH6, PMS1, PMS2) după reducerea sau supraproducÈ›ia TDP43;
  • modificările procesării ARN-ului pre-mesager la nivelul situsurilor exon-intron;
  • stabilitatea transcrierilor MMR în condiÈ›ii de inhibare a sintezei ARN;
  • efectele funcÈ›ionale asupra markerilor de deteriorare a ADN-ului È™i asupra supravieÈ›uirii celulare în condiÈ›ii de stres genotoxic;
  • corelaÈ›iile dintre expresia genei TARDBP (care codifică TDP43), nivelurile MMR È™i prognosticul pacienÈ›ilor în multiple tipuri de cancer.

Date statistice și tehnici utilizate

Analizele cantitative au inclus:

  • RT2-PCR matrice pentru 84 de gene din răspunsul la deteriorarea ADN-ului;
  • qRT-PCR în triplicat pentru validare;
  • Western bloturi normalizate la GAPDH sau colorarea proteinelor totale;
  • teste de viabilitate celulară MTT;
  • comet assay pentru cuantificarea rupturilor de ADN;
  • măsurarea timpului de înjumătățire al transcrierilor folosind modele de decădere de ordinul I;
  • regresii liniare pentru evaluarea coexpresiei în 33 de tipuri de tumori;
  • analiza încărcăturii mutaÈ›ionale prin baza de date COSMIC;
  • Gene Set Enrichment Analysis pentru clasificarea funcÈ›ională a genelor coexprimate.

Rezultate

1. TDP43 controlează expresia genelor MMR

Reducerea TDP43 cu aproximativ 50% în celulele HEK293 a determinat o scădere cu peste 2 ori a expresiei MLH1, MSH3, MSH6 È™i PMS2. Aceste rezultate au fost validate prin qRT-PCR È™i Western blot, confirmând atât scăderea transcrierilor, cât È™i a proteinelor. În schimb, supraproducÈ›ia TDP43 în neuroni diferenÈ›iaÈ›i SH-SY5Y a crescut nivelurile proteinelor MMR peste valorile bazale.

2. Reglarea MMR este conservată în celule neuronale

În celulele stem neuronale È™i în neuronii derivaÈ›i din iPSC, scăderea TDP43 a redus nivelurile MLH1, MSH3, MSH6 È™i PMS2. Pe măsură ce celulele se diferenÈ›iau spre stadiul neuronal, expresia MMR scădea natural, ceea ce sugerează un echilibru fin necesar în celulele mature. TDP43 perturbat influenÈ›a acest echilibru în ambele direcÈ›ii.

3. TDP43 reglează procesarea ARN-ului MMR

Analiza situsurilor de legare TDP43 pe transcrierile MLH1 și MSH6 a arătat multiple regiuni UG-rich, compatibile cu legarea directă. Reducerea TDP43 a dus la:

  • creÈ™terea variantelor neprocesate (cu introni reÈ›inuÈ›i);
  • scăderea transcrierilor complet splicate cu peste 50%;
  • apariÈ›ia de produse alternative identificate prin minigene assay.


Aceste rezultate indică faptul că TDP43 este necesar pentru splicing corect al transcrierilor MMR.

4. TDP43 crește stabilitatea transcrierilor MMR

În prezenÈ›a inhibitorului de ARN polimerază II α-amanitin:

  • timpul de înjumătățire al MLH1 a scăzut cu 38%;
  • timpul de înjumătățire al MSH6 a scăzut cu 56%.


În absenÈ›a TDP43, transcrierile MMR se degradează deci accelerat.

5. Modelele animale ALS–TDP43 prezintă dereglări MMR

În două modele murine distincte:

  • expresia MSH2, MSH3 È™i MSH6 a fost crescută în cortex;
  • supraproducÈ›ia TDP43 a indus creÈ™teri suplimentare ale MLH1;
  • s-au observat diferenÈ›e dependente de sex în expresia MMR în anumite contexte.


În È›esuturile cerebrale post-mortem de la pacienÈ›i cu ALS din Guam, proteinele MLH1, MSH3 È™i MSH6 erau crescute în fracÈ›ia insolubilă, sugerând acumulare patologică.

6. MMR contribuie la deteriorarea ADN-ului indusă de TDP43

În modele neuronale cu TDP43 deplasat gresit:

  • ruperile ADN erau crescute (comet assay);
  • markerii γH2AX È™i ATM erau activaÈ›i persistent;
  • blocarea MSH2 reducea semnificativ deteriorarea ADN È™i răspunsul DDR.


Astfel, supraactivitatea MMR în celule postmitotice poate deveni maladaptativă.

7. CorelaÈ›ii puternice între TDP43 È™i MMR în cancer

Analiza TCGA a arătat că:

  • TARDBP este supraexprimat în 60% dintre tipurile de cancer studiate;
  • MSH6 este coexpresat cu TDP43 în 20 tipuri de tumori;
  • MSH2 este coexpresat în 15 tipuri;
  • pacienÈ›ii cu nivel crescut TDP43 au prognostic mai prost în sarcom, carcinom hepatic, carcinom adrenal È™i gliom de grad scăzut;
  • tumorile cu expresie crescută TDP43, MSH2 È™i MSH6 prezintă încărcătură mutaÈ›ională semnificativ mai ridicată (ex. cancerul mamar, pulmonar, vezical).


Setul de gene coexprimate cu TDP43 era puternic îmbogățit în procese legate de repararea ADN-ului, replicare, mitoză È™i SUMOilare.


Data actualizare: 03-12-2025 | creare: 03-12-2025 | Vizite: 75
Bibliografie
Provasek, V. E., et al. (2025). RNA/DNA-binding protein TDP43 regulates DNA mismatch repair genes with implications for genome stability. Nucleic Acids Research. DOI: 10.1093/nar/gkaf920. https://academic.oup.com/nar/article/53/18/gkaf920/8262242
©

Copyright ROmedic: Articolul se află sub protecția drepturilor de autor. Reproducerea, chiar și parțială, este interzisă!


Din Biblioteca medicală vă mai recomandăm:
Forumul ROmedic - întrebări și răspunsuri medicale:
Pe forum găsiți peste 500.000 de întrebări și răspunsuri despre boli sau alte subiecte medicale. Aveți o întrebare? Primiți răspunsuri gratuite de la medici.
  intră pe forum