Un test genomic revoluționează detectarea rapidă a agenților patogeni

Un grup de cercetători de la Universitatea din California, San Francisco (UCSF), a dezvoltat un test genomic capabil să detecteze rapid aproape orice tip de agent patogen - virusuri, bacterii, fungi sau paraziți - dovedindu-se eficient după un deceniu de utilizare. Testul utilizează tehnica puternică de secvențiere metagenomică de generație următoare (mNGS). Spre deosebire de metodele tradiționale care caută un singur tip de agent patogen, mNGS analizează toți acizii nucleici, ARN și ADN, prezenți într-o probă.

Aplicarea în infecțiile neurologice

Inițial, cercetătorii au dezvoltat testul mNGS pentru a analiza lichidul cefalorahidian (LCR), fluidul care înconjoară creierul și măduva spinării. Testul a fost utilizat la mii de pacienți cu simptome neurologice inexplicabile, atât la UCSF, cât și în alte spitale din SUA.

Într-un studiu publicat în Nature Medicine, echipa a demonstrat că testul mNGS a identificat corect 86% dintre infecțiile neurologice. Aceasta reprezintă o îmbunătățire semnificativă față de metodele tradiționale de diagnostic, eliminând necesitatea unor teste multiple și economisind timp prețios în tratamentul pacienților.

Extinderea la patogeni respiratori și pregătirea pentru pandemii

Într-un studiu complementar publicat în Nature Communications, cercetătorii au utilizat mNGS pentru a identifica patogeni în fluidele respiratorii care pot cauza pneumonie, automatizând procesul pentru a obține rezultate mai rapide. Testul automatizat poate detecta potențiali patogeni virali noi care ar putea declanșa pandemii respiratorii, precum COVID-19.

Adaptarea testului pentru fluidele respiratorii și automatizarea acestuia permit obținerea rezultatelor în mai puțin de o zi, servind ca sistem de avertizare timpurie pentru pandemii.

Recunoaștere și disponibilitate

Ambele versiuni ale testului mNGS - pentru lichidul cefalorahidian și pentru patogeni respiratori - au primit desemnarea de dispozitiv inovator din partea Administrației pentru Alimente și Medicamente din SUA (FDA). Pentru a extinde accesul la această tehnologie, cercetătorii au întemeiat compania Delve Bio, care oferă acum testul mNGS dezvoltat la UCSF.

Concluzie

Testul mNGS reprezintă un progres semnificativ în diagnosticul rapid și precis al infecțiilor, având potențialul de a îmbunătăți îngrijirea pacienților cu infecții neurologice și de a accelera detectarea noilor amenințări pandemice.

sursa: Science Daily
foto: Medicul și microbiologul în boli infecțioase de la UCS, Charles Chiu, MD, PhD, urmărește cum un robot extrage ADN dintr-o probă. Photo by Noah Berger