Un nou tip de deteriorare a ADN-ului mitocondrial a fost dezvăluit
Autor: Airinei Camelia

Un studiu condus de University of California - Riverside È™i publicat în Proceedings of the National Academy of Sciences a analizat modul în care aductele de ADN glutationilat (GSH–ADN) se acumulează în genomul mitocondrial È™i influenÈ›ează funcÈ›ionarea organitului. Autorii au investigat atât formarea acestor aducte, cât È™i mecanismele de reglare È™i consecinÈ›ele lor asupra expresiei proteice mitocondriale È™i potenÈ›ialului inflamator.
Mitocondriile sunt esențiale pentru metabolismul celular și semnalizarea intracelulară. Genomul mitocondrial (mtADN), deși compact, codifică componente critice ale lanțului respirator și prezintă heteroplazie și vulnerabilitate ridicată la stresul oxidativ. Spre deosebire de genomul nuclear, mtADN dispune de mecanisme de reparare limitate și acumulează rapid leziuni.
Una dintre cele mai importante forme de leziune o reprezintă sit-urile abazinice (AP), intermediari ai reparării prin excizie de bază. Aceste sit-uri reactivate pot genera compuÈ™i instabili, precum 3’-PUA, care pot reacÈ›iona cu glutation, rezultând aducte GSH–ADN. DeÈ™i astfel de aducte au fost identificate anterior în genomul nuclear, rolul lor biologic era necunoscut.
Mitocondriile nu doar acumulează leziuni, ci pot elibera fragmente de mtADN în citoplasmă, unde acestea acÈ›ionează ca molecule semnalizatoare ale stresului (DAMP), stimulând inflamaÈ›ia. Având în vedere rolul cunoscut al leziunii oxidate 8-oxodG în activarea imunității înnăscute, autorii au explorat dacă È™i aductele GSH–ADN pot avea efecte similare.
Despre studiu
Metodologie generală
Studiul a utilizat:
- măsurători prin spectrometrie de masă cu diluÈ›ie izotopică pentru cuantificarea aductelor GSH–ADN;
- modele celulare umane expuse la diferite surse de stres genotoxic (ex. inducerea AP-urilor prin UNG1-Y147A, tratamentul cu MNU);
- linii celulare knockout pentru APE1 È™i TDP1, enzime-cheie în repararea leziunilor 3’;
- analize proteomice (SILAC) pentru evaluarea modificărilor de expresie proteică mitocondrială;
- simulări de dinamică moleculară pentru a caracteriza efectele structurale ale aductelor asupra ADN-ului È™i a complexelor ADN–TFAM.
Cuantificarea aductelor GSH–ADN
Autorii au comparat nivelurile aductelor în genomul nuclear È™i în cel mitocondrial, analizând atât condiÈ›ii bazale, cât È™i expuneri la stres. Procedura a implicat derivatizarea chimică a leziunilor È™i utilizarea standardelor interne etichetate izotopic pentru măsurări exacte la nivel de nucleotid.
Rolul enzimelor de reparare APE1 și TDP1
Pentru a clarifica contribuÈ›ia diferitelor enzime la prevenirea acumulării de aducte, au fost utilizate linii celulare cu deficit de APE1 sau TDP1. S-au efectuat teste cinetice cu substraturi definite pentru a evalua eficienÈ›a catalitică asupra leziunilor 3’-GS-ddR.
Influența TFAM și a poliaminelor
Autorii au evaluat modul în care TFAM (factorul de transcripÈ›ie mitocondrial A), principalul organizator al nucleoidului, È™i poliaminele mitocondriale (spermină, spermidină) modulatează formarea aductelor GSH–ADN.
Impactul asupra proteinelor mitocondriale
Proteomul mitocondrial a fost analizat în condiÈ›ii de acumulare a aductelor, pentru a evalua modificările funcÈ›ionale secundare la nivelul expresiei proteice.
Analiza structurală prin simulări MD
S-au efectuat simulări pentru a studia modul în care aductele modifică flexibilitatea ADN-ului È™i stabilitatea complexelor TFAM–ADN.
Rezultate
1. Aductele GSH–ADN se acumulează masiv în genomul mitocondrial
Studiul arată că mtADN conÈ›ine niveluri de 13–300 ori mai mari de aducte GSH–ADN decât genomul nuclear. CreÈ™terea artificială a sit-urilor AP a dus la o creÈ™tere de 5 ori a aductelor în mtADN, confirmând formarea lor directă din intermediari ai BER.
2. APE1 este principalul factor protector împotriva acumulării aductelor
Liniile knockout pentru APE1 au prezentat o acumulare masivă a aductelor în mtADN, atribuibilă eficienÈ›ei catalitice superioare a APE1 È™i abundenÈ›ei sale crescute în mitocondrii. TDP1 contribuie în special la prevenirea acumulării bazale, dar are eficiență mai scăzută decât APE1.
3. TFAM inhibă formarea aductelor, iar poliaminele o accelerează
Experimentele biochimice au arătat că:
- TFAM concurează cu GSH pentru sit-urile AP, favorizând legături ADN–proteină în detrimentul aductelor GSH–ADN;
- poliaminele catalizează formarea aductelor, mai ales în zonele cu ocupare TFAM redusă;
- organizarea nucleoidului determină distribuția regională a tipurilor de leziuni.
4. Efecte proteomice: scăderea sintezei mitocondriale și activarea mecanismelor redox
Acumularea aductelor în mtADN a fost asociată cu:
- scăderea subunităților ribozomale mitocondriale;
- reducerea subunităților complexului I, implicând afectarea bioenergeticii;
- creșterea nivelurilor PRDX6, un regulator al homeostaziei redox;
- upreglarea ARF5 (trafficking proteic) și DNM1L (dinamică mitocondrială).
5. Aductele cresc flexibilitatea ADN-ului și stabilizează legarea TFAM
Simulările MD au arătat că 3’-GS-ddR:
- crește mobilitatea locală și globală a dublului helix;
- formează interacțiuni suplimentare cu nucleobazele;
- determină scăderea energiei de legare a complexelor TFAM–ADN, sugerând o stabilizare patologică a acestora.
Concluzii
Acest studiu oferă o imagine complexă a modului în care aductele GSH–ADN se formează, se acumulează È™i influenÈ›ează biologia mitocondrială. Rezultatele subliniază:
- rolul esenÈ›ial al APE1 în protecÈ›ia mtADN;
- interacÈ›iunea critică între TFAM, poliamine È™i dinamica reparării ADN;
- impactul semnificativ al acestor leziuni asupra expresiei proteice mitocondriale;
- posibilul rol al aductelor în activarea inflamaÈ›iei È™i a răspunsului imun înnăscut.
Faptul că nivelul aductelor GSH–ADN este comparabil cu cel al 8-oxodG, o marcă clasică a stresului oxidativ, sugerează că aceste aducte pot reprezenta un nou tip de semnal mitocondrial al stresului genotoxic.
Image by freepik on Freepik
Copyright ROmedic: Articolul se află sub protecția drepturilor de autor. Reproducerea, chiar și parțială, este interzisă!
- Implant silicon sani
- Pentru cei cu anxietate si atacuri de panica FOARTE IMPORTANT
- GRUP SUPORT PENTRU TOC 2014
- Histerectomie totala cu anexectomie bilaterala
- Grup de suport pentru TOC-CAP 15
- Roaccutane - pro sau contra
- Care este starea dupa operatie de tiroida?
- Helicobacter pylori
- Medicamente antidepresive?
- Capsula de slabit - mit, realitate sau experiente pe oameni