Inteligența artificială și revoluția în dezvoltarea anticorpilor terapeutici

Un proiect inovator condus de Vanderbilt University Medical Center (VUMC) vizează utilizarea inteligenÈ›ei artificiale (IA) pentru a genera terapii cu anticorpi împotriva oricărui antigen de interes. Această iniÈ›iativă a primit o finanÈ›are de până la 30 de milioane de dolari din partea Advanced Research Projects Agency for Health (ARPA-H), o agenÈ›ie a Departamentului Sănătății È™i Serviciilor Umane din SUA, care sprijină cercetarea biomedicală de mare impact È™i cu potenÈ›ial transformator.
Necesitatea unei noi abordări
Anticorpii monoclonali au devenit esenÈ›iali în tratarea unei game largi de boli, însă metodele tradiÈ›ionale de descoperire a acestora sunt ineficiente, costisitoare È™i dificil de scalat. Procesul obiÈ™nuit implică testarea È™i selectarea unor anticorpi eficienÈ›i din mii de variante, necesitând acces la probe biologice specifice È™i întâmpinând dificultăți majore în faÈ›a mutaÈ›iilor antigenice.
"Ceea ce propunem noi este să eliminăm aceste blocaje majore ale procesului tradițional de descoperire a anticorpilor și să creăm un sistem mai eficient și accesibil. Scopul este să identificăm rapid anticorpi terapeutici pentru orice antigen", a explicat Ivelin Georgiev, PhD, director al Vanderbilt Center for Computational Microbiology and Immunology și investigator principal al proiectului.
Obiectivele proiectului
Cercetătorii de la VUMC îÈ™i propun să atingă trei obiective majore:
-
Construirea unui atlas masiv de interacțiuni antigen-anticorp
-
Dezvoltarea unor algoritmi IA pentru generarea de anticorpi specifici antigenilor
-
Demonstrarea aplicabilității acestor tehnologii în descoperirea de anticorpi terapeutici
1. Crearea atlasului antigen-anticorp
Pentru prima etapă, cercetătorii vor folosi tehnologia LIBRA-seq (Linking B-cell Receptor to Antigen specificity through sequencing), o metodă care permite cartografierea simultană a numeroase interacÈ›iuni între antigeni È™i celule B producătoare de anticorpi.
Acest atlas va conÈ›ine sute de mii, posibil peste un milion, de perechi antigen-anticorp, comparativ cu cele aproximativ 15.000 disponibile în prezent din date publicate. Un astfel de volum de informaÈ›ii va furniza cercetătorilor un instrument fără precedent pentru antrenarea algoritmilor de inteligență artificială.
2. Dezvoltarea algoritmilor IA pentru generarea de anticorpi
Utilizând datele din atlas, echipa VUMC va dezvolta modele computaÈ›ionale avansate pentru a proiecta È™i optimiza anticorpi specifici antigenilor. Spre deosebire de metodele convenÈ›ionale, această abordare nu depinde de probe biologice È™i poate anticipa mutaÈ›iile antigenilor, facilitând dezvoltarea rapidă a anticorpilor eficienÈ›i.
"Dacă antrenăm algoritmii doar pe datele existente - majoritatea fiind pentru SARS-CoV-2, gripă È™i HIV - aceÈ™tia vor avea dificultăți în a genera anticorpi pentru noi È›inte. De aceea, diversitatea antigenică este esenÈ›ială pentru succesul acestei tehnologii", a explicat Georgiev.
3. Aplicarea tehnologiei IA în descoperirea de anticorpi
Ultima etapă va implica utilizarea inteligenÈ›ei artificiale pentru generarea de anticorpi împotriva antigenilor asociaÈ›i cancerului, bacteriilor, virusurilor È™i bolilor autoimune. Un anticorp candidat va fi selectat pentru dezvoltare preclinică până la etapa IND (investigational new drug application), care precede studiile clinice umane.
"Această platformă va fi utilizabilă pentru multe boli, nu doar pentru cele studiate în acest proiect. Dacă reuÈ™im să eficientizăm descoperirea anticorpilor, impactul va fi enorm pentru întregul domeniu medical", a declarat Georgiev.
Impactul proiectului
Acest proiect are potenÈ›ialul de a revoluÈ›iona dezvoltarea terapiilor cu anticorpi, permiÈ›ând:
-
Descoperirea mai rapidă și eficientă a anticorpilor terapeutici
-
Crearea unor terapii mai accesibile și scalabile
-
Adaptarea rapidă la mutațiile agenților patogeni
-
Extinderea aplicaÈ›iilor în cancer, boli autoimune È™i infecÈ›ioase
Proiectul implică o echipă de cercetători de la VUMC, Cleveland Clinic și University of Copenhagen, fiind susținut de Brock Family Center for Applied Innovation. De asemenea, beneficiază de resursele comune ale Vanderbilt University, inclusiv VANTAGE (Vanderbilt Technologies for Advanced Genomics), ACCRE (Advanced Computing Center for Research and Education) și FCSR (Flow Cytometry Shared Resource).
Concluzii
Prin combinarea tehnologiilor avansate de inteligență artificială, biologie computaÈ›ională È™i imunologie, proiectul de la VUMC promite să transforme descoperirea È™i dezvoltarea anticorpilor terapeutici. Cu un atlas antigen-anticorp fără precedent È™i modele IA capabile să genereze anticorpi eficienÈ›i, această iniÈ›iativă ar putea accelera semnificativ progresele în tratamentele bazate pe anticorpi, oferind noi speranÈ›e pentru pacienÈ›ii cu afecÈ›iuni fără soluÈ›ii terapeutice actuale.
https://www.vumc.org/main/home
Image by rawpixel.com on Freepik
Copyright ROmedic: Articolul se află sub protecția drepturilor de autor. Reproducerea, chiar și parțială, este interzisă!
- Monitor de sănătate microfluidic flexibil imprimat 3D pentru analizarea transpirației și detectarea biomarkerilor
- Cercetătorii dezvoltă o mască LED adaptabilă care îmbunătățește elasticitatea pielii cu 340%
- Generarea electricității prin dispozitive atașate la haine
- Oamenii de știință au creat probiotice încapsulate care ar putea fi administrate intestinal mai eficient
- TORCH - pozitiv IGG anticorpi pentru: Rubeola, Citomegalovirus si HSV1
- Anticorpi antispermatozoizi in ser
- Igm pozitiv
- Ac celule gastrice