Saliva, o sursă promițătoare de biomarkeri epigenetici pentru boli complexe
Autor: Airinei Camelia

Un studiu condus de Universitatea din Țara Bască a demonstrat potențialul salivei de a servi ca mediu de diagnostic pentru boli complexe care depășesc aria cavității bucale. Prin combinarea datelor genomice, de metilare a ADN-ului și de expresie genică, cercetătorii au creat cele mai ample baze de date publice de loci cantitativi de metilare și expresie - mQTL și eQTL din salivă, evidențiind rolul acesteia ca sursă non-invazivă de informații biologice relevante pentru sănătatea sistemică.
Metodele moderne de analiză genomică la scară largă, cum ar fi studiile de asociere la nivelul întregului genom, au identificat numeroase variante genetice asociate cu riscul de boli complexe. TotuÈ™i, interpretarea mecanismelor moleculare rămâne dificilă, mai ales pentru regiunile non-coding. În paralel, studiile asupra metilării ADN-ului au scos în evidență rolul acesteia ca potenÈ›ial mediator între variaÈ›ia genetică È™i manifestările clinice. Saliva s-a conturat în ultimii ani ca un mediu accesibil È™i stabil, care poate reflecta starea sistemică È™i poate furniza ADN de înaltă calitate.
Despre studiu
Cercetătorii au analizat probe de salivă de la adulÈ›i din populaÈ›ia generală, integrând date despre genotip, metilare a ADN-ului (DNAm) È™i expresie genică. Obiectivele au inclus:
- Construirea unei baze de date cu mQTL din salivă, prin testarea a peste 5 milioane de variante genetice în asociere cu 736.680 de situri CpG.
- Crearea bazei de date cu eQTL la nivel de gene și transcripte.
- Identificarea, prin analiză Mendelian randomization, a siturilor CpG și genelor asociate pleiotropic cu cancere, boli cardiometabolice și neurodegenerative.
- Explorarea relației dintre nivelul metilării și expresia genică (eQTM-uri).
În total, studiul a inclus:
- 345 de probe pentru mQTL.
- 277 de probe pentru eQTL.
- 271 de probe pentru analiza eQTM.
Analizele au fost completate cu evaluarea contribuției acestor variante la ereditatea estimată a bolilor complexe.
Rezultate principale
mQTL identificate:
- 123.451 situri CpG cu asocieri semnificative cu variația genetică (16,76% din totalul siturilor testate).
- DistanÈ›a mediană între SNP-uri È™i CpG-uri: 12,6 Kb.
- Siturile mQTL au fost mai frecvente în regiuni open sea È™i în zonele de margine ale insulelor CpG, fiind rare în regiuni puternic hipometilate (CpG islands).
eQTL identificate:
- 1717 gene și 1770 transcripte cu expresie influențată genetic.
- DistanÈ›ele mediane între variante È™i gene: 63 Kb (gene) È™i 54 Kb (transcripte).
Analiza SMR:
- 501 situri CpG asociate cu cel puțin o boală complexă (cancere, boli cardiometabolice și neurodegenerative).
- 28 gene candidate cu rol potențial biomarker.
- Asocieri remarcabile cu boala Parkinson, diabet zaharat de tip 2 și cancer de prostată.
Heritabilitate:
- mQTL au explicat un procent semnificativ mai mare din ereditatea bolilor comparativ cu eQTL. De exemplu, pentru boala coronariană, mQTL au explicat 70,5% din ereditate, iar eQTL doar 2,9%.
Implicații și perspective
Rezultatele subliniază capacitatea DNAm din salivă de a surprinde variații relevante pentru boli care depășesc cavitatea orală. Stabilitatea metilării ADN-ului, ușurința colectării probelor și consistența semnalelor detectate fac din salivă un mediu foarte promițător pentru diagnosticul non-invaziv.
În plus, identificarea unor corelaÈ›ii clare între nivelul metilării CpG È™i expresia genică în aceleaÈ™i regiuni sugerează mecanisme moleculare comune care pot fi utilizate ca È›inte pentru diagnostic precoce sau intervenÈ›ii terapeutice.
Publicarea acestor baze de date È™i dezvoltarea unei platforme web accesibile (https://irlab.shinyapps.io/salivaQTL/) permit cercetătorilor să exploreze independent datele È™i să le integreze în proiecte viitoare.
Concluzii
Prin combinarea datelor multi-omice, studiul demonstrează superioritatea clară a mQTL în explicaÈ›ia riscului genetic pentru boli complexe. Saliva se conturează astfel ca un mediu accesibil, stabil È™i valoros pentru identificarea biomarkerilor epigenetici relevanÈ›i sistemic. Integrarea acestor descoperiri în strategii de medicină personalizată È™i diagnostic non-invaziv ar putea transforma modul în care sunt detectate È™i monitorizate afecÈ›iunile cronice.
Image by rawpixel.com on Freepik
Copyright ROmedic: Articolul se află sub protecția drepturilor de autor. Reproducerea, chiar și parțială, este interzisă!
- Temperatura facială poate prezice cu acuratețe bolile cardiovasculare
- Analizele de sânge de rutină ar putea accelera diagnosticarea cancerului pentru pacienții cu dureri de stomac sau balonare
- Rahianestezia spinală la nou-născuții prematuri: o alternativă sigură la anestezia generală pentru corectarea herniei inghinale
- Inteligența artificială prezice cu acuratețe infertilitatea masculină din nivelurile hormonale
- Stimulare secretie salivara
- Saliva cleioasa
- Un sfat va rog.. salivă maronie închisă
- Saliva vâscoasă
- Scuip des
- Probleme raspiratoare si saliva groasa.
- Saliva alba lipicioasa ca laptele
- Saliva abundenta