Saliva, o sursă promițătoare de biomarkeri epigenetici pentru boli complexe

Saliva, o sursă promițătoare de biomarkeri epigenetici pentru boli complexe

©

Autor:

Saliva, o sursă promițătoare de biomarkeri epigenetici pentru boli complexe

Un studiu condus de Universitatea din Țara Bască a demonstrat potențialul salivei de a servi ca mediu de diagnostic pentru boli complexe care depășesc aria cavității bucale. Prin combinarea datelor genomice, de metilare a ADN-ului și de expresie genică, cercetătorii au creat cele mai ample baze de date publice de loci cantitativi de metilare și expresie - mQTL și eQTL din salivă, evidențiind rolul acesteia ca sursă non-invazivă de informații biologice relevante pentru sănătatea sistemică.
Metodele moderne de analiză genomică la scară largă, cum ar fi studiile de asociere la nivelul întregului genom, au identificat numeroase variante genetice asociate cu riscul de boli complexe. TotuÈ™i, interpretarea mecanismelor moleculare rămâne dificilă, mai ales pentru regiunile non-coding. În paralel, studiile asupra metilării ADN-ului au scos în evidență rolul acesteia ca potenÈ›ial mediator între variaÈ›ia genetică È™i manifestările clinice. Saliva s-a conturat în ultimii ani ca un mediu accesibil È™i stabil, care poate reflecta starea sistemică È™i poate furniza ADN de înaltă calitate.

Despre studiu

Cercetătorii au analizat probe de salivă de la adulÈ›i din populaÈ›ia generală, integrând date despre genotip, metilare a ADN-ului (DNAm) È™i expresie genică. Obiectivele au inclus:

  • Construirea unei baze de date cu mQTL din salivă, prin testarea a peste 5 milioane de variante genetice în asociere cu 736.680 de situri CpG.
  • Crearea bazei de date cu eQTL la nivel de gene È™i transcripte.
  • Identificarea, prin analiză Mendelian randomization, a siturilor CpG È™i genelor asociate pleiotropic cu cancere, boli cardiometabolice È™i neurodegenerative.
  • Explorarea relaÈ›iei dintre nivelul metilării È™i expresia genică (eQTM-uri).


În total, studiul a inclus:

  • 345 de probe pentru mQTL.
  • 277 de probe pentru eQTL.
  • 271 de probe pentru analiza eQTM.


Analizele au fost completate cu evaluarea contribuției acestor variante la ereditatea estimată a bolilor complexe.

Rezultate principale

mQTL identificate:

  • 123.451 situri CpG cu asocieri semnificative cu variaÈ›ia genetică (16,76% din totalul siturilor testate).
  • DistanÈ›a mediană între SNP-uri È™i CpG-uri: 12,6 Kb.
  • Siturile mQTL au fost mai frecvente în regiuni open sea È™i în zonele de margine ale insulelor CpG, fiind rare în regiuni puternic hipometilate (CpG islands).


eQTL identificate:

  • 1717 gene È™i 1770 transcripte cu expresie influenÈ›ată genetic.
  • DistanÈ›ele mediane între variante È™i gene: 63 Kb (gene) È™i 54 Kb (transcripte).


Analiza SMR:

  • 501 situri CpG asociate cu cel puÈ›in o boală complexă (cancere, boli cardiometabolice È™i neurodegenerative).
  • 28 gene candidate cu rol potenÈ›ial biomarker.
  • Asocieri remarcabile cu boala Parkinson, diabet zaharat de tip 2 È™i cancer de prostată.


Heritabilitate:

  • mQTL au explicat un procent semnificativ mai mare din ereditatea bolilor comparativ cu eQTL. De exemplu, pentru boala coronariană, mQTL au explicat 70,5% din ereditate, iar eQTL doar 2,9%.

Implicații și perspective

Rezultatele subliniază capacitatea DNAm din salivă de a surprinde variații relevante pentru boli care depășesc cavitatea orală. Stabilitatea metilării ADN-ului, ușurința colectării probelor și consistența semnalelor detectate fac din salivă un mediu foarte promițător pentru diagnosticul non-invaziv.

În plus, identificarea unor corelaÈ›ii clare între nivelul metilării CpG È™i expresia genică în aceleaÈ™i regiuni sugerează mecanisme moleculare comune care pot fi utilizate ca È›inte pentru diagnostic precoce sau intervenÈ›ii terapeutice.

Publicarea acestor baze de date È™i dezvoltarea unei platforme web accesibile (https://irlab.shinyapps.io/salivaQTL/) permit cercetătorilor să exploreze independent datele È™i să le integreze în proiecte viitoare.

Concluzii

Prin combinarea datelor multi-omice, studiul demonstrează superioritatea clară a mQTL în explicaÈ›ia riscului genetic pentru boli complexe. Saliva se conturează astfel ca un mediu accesibil, stabil È™i valoros pentru identificarea biomarkerilor epigenetici relevanÈ›i sistemic. Integrarea acestor descoperiri în strategii de medicină personalizată È™i diagnostic non-invaziv ar putea transforma modul în care sunt detectate È™i monitorizate afecÈ›iunile cronice.


Data actualizare: 27-06-2025 | creare: 27-06-2025 | Vizite: 339
Bibliografie
Hernangomez-Laderas, A., et al. (2025). Saliva as a potential diagnostic medium: DNA methylation biomarkers for disorders beyond the oral cavity. npj Genomic Medicine. https://doi.org/10.1038/s41525-025-00509-0

Image by rawpixel.com on Freepik
©

Copyright ROmedic: Articolul se află sub protecția drepturilor de autor. Reproducerea, chiar și parțială, este interzisă!

Alte articole din aceeași secțiune:

Din Biblioteca medicală vă mai recomandăm:
Forumul ROmedic - întrebări și răspunsuri medicale:
Pe forum găsiți peste 500.000 de întrebări și răspunsuri despre boli sau alte subiecte medicale. Aveți o întrebare? Primiți răspunsuri gratuite de la medici.
  intră pe forum