Analiza ADN accesibilă oricui: tricorderul din Star Trek, transpus în realitate

Oamenii de știință de la Cold Spring Harbor Laboratory (CSHL) au dezvoltat primul analizor portabil de secvențiere a genomului din lume, o nouă aplicație disponibilă pentru dispozitivele iPhone, numită iGenomics. Prin asocierea unui iPhone cu un secvențiator de ADN portabil, utilizatorii vor putea crea un laborator de genetică mobil, care amintește de „tricorderul” prezentat în Star Trek. Aplicația iGenomics rulează în întregime pe dispozitivul iOS și a fost dezvoltată pentru a completa micile dispozitive de secvențiere a ADN-ului realizate de Oxford Nanopore.

Majoritatea dispozitivelor folosite pentru alinierea și analiza ADN-ului necesită stocarea datelor pe servere sau laptopuri de ultimă generație. În schimb, iGenomics va putea oferi informații vitale oricărui utilizator de iPhone, fără a fi necesară conexiune la un laptop sau la un alt dispozitiv de dimensiuni mari. Utilizatorii vor putea să realizeze analiza ADN din cele mai îndepărtate locații - chiar și din cele fără acces la internet.

Algoritmul aplicației poate identifica rapid secvențele ADN ale agenților patogeni virali, cum ar fi virusul gripei sau virusul Zika și poate identifica mutațiile importante, pentru diagnostic și tratament. De asemenea, aplicația oferă un tutorial online pentru analiza altor genomi virali, cum ar fi de la un pacient cu SARS-CoV-2. Michael Schatz, profesor asociat de informatică și biologie la Universitatea Johns Hopkins, își dorește ca acest nou dispozitiv să ajute profesioniștii din domeniul medical și oamenii de știință deopotrivă: „Astăzi, cu toții avem camere profesionale în buzunar, așa că nu este atât de greu de imaginat în următorii câțiva ani, cu toții purtând propriile noastre secvențieri ADN pe smartphone-urile noastre.”

Programatorul aplicatiei, Aspyn Palatnick, consideră că iGenomics ar putea fi folosită în curând de către astronauți. „Există mult interes pentru secvențierea ADN-ului în spațiu. Încerc să văd dacă există o modalitate prin care putem duce iGenomics acolo. Există o mulțime de oameni care sunt interesați să facă asta.”

sursa: Science Daily
foto: Scroll.in