Studiul ADN-ului canin descoperă noi gene legate de cancerul gastric uman

Studiul ADN-ului canin descoperă noi gene legate de cancerul gastric uman

©

Autor:

Studiul ADN-ului canin descoperă noi gene legate de cancerul gastric uman
Un studiu genomic extins publicat în Proceedings of the National Academy of Sciences a analizat predispoziÈ›ia genetică pentru cancer gastric la câinii din rasele Belgian Tervuren È™i Belgian Sheepdog. Studiul a identificat 15 loci genetici asociaÈ›i cu boala È™i a evidenÈ›iat genele HDAC2, SOX2-OT È™i IGF2BP2 ca fiind implicate în susceptibilitatea È™i protecÈ›ia față de cancerul gastric. Datorită asemănării clinice È™i histopatologice cu cancerul gastric uman, aceste rase canine reprezintă un model natural promițător pentru înÈ›elegerea geneticii bolii umane.
Cancerul gastric este a cincea cauză principală de mortalitate oncologică la nivel mondial. Adenocarcinomul gastric reprezintă 90% din cazuri, dintre care subtipul intestinal se dezvoltă în paÈ™i progresivi de la inflamaÈ›ie cronică la metaplazie È™i displazie. Helicobacter pylori este un factor de risc major pentru subtipul intestinal, dar baza genetică a formelor familiale rămâne slab înÈ›eleasă. Studii GWAS anterioare la oameni au identificat polimorfisme asociate cu riscul, însă majoritatea cazurilor sporadice rămân fără o cauză genetică cunoscută.

La câini, cancerul gastric este rar (<1%), dar apare frecvent (până la 5%) la Tervuren È™i Sheepdog, sugerând o componentă genetică puternică. IncidenÈ›a crescută în aceste rase, combinate cu gradul ridicat de omogenitate genetică, oferă o oportunitate unică de a identifica loci cu impact semnificativ în susceptibilitatea la boală.

Despre studiul actual

Cercetătorii au analizat 200 de cazuri (151 Tervuren, 49 Sheepdog) È™i 270 de controale. Vârsta medie la diagnostic a fost 9,2 ani pentru cazuri È™i 13,2 ani pentru controale. Nu s-au observat diferenÈ›e semnificative legate de sex.

Analizele au inclus:
  • Imputarea datelor de pe matrice SNP folosind un panou de referință WGS cuprinzând peste 1.100 de câini.
  • Modelare GWAS bayesiană (BayesR), care a estimat simultan efectele a ~577.000 de variante.
  • Analiza XP-nSL pentru detecÈ›ia semnăturilor de selecÈ›ie (homoziogozitate extinsă).

Rezultatele principale:
  • 15 loci genetici au fost asociaÈ›i cu cancerul gastric, dintre care 8 au avut efect moderat (efect ≥ 0.001).
  • Regiunea de cel mai mare impact a fost pe CFA20, conÈ›inând gena PDZRN3.
  • Alte regiuni de interes au inclus: PTEN (CFA26), KLHL29 (CFA17), CD101 (CFA17), HDAC2 (CFA12), EPAS1/HIF2A (CFA10).

Rezultate

Loci asociați și validare

Modelul aditiv cu 15 loci a avut o capacitate predictivă internă ridicată (AUC = 0.918, 95% CI: 0.893–0.943). În cohorta independentă de validare, AUC-ul a fost de 0.636, sugerând o uÈ™oară supracalibrare în cohorta GWAS, dar susÈ›inând validitatea biologică a principalilor loci identificaÈ›i.

Câinii din rasa Malinois, care sunt înrudiÈ›i genetic dar nu prezintă risc crescut, aveau un număr semnificativ mai mic de alele de risc (medie: 15.4 vs. 20.3 în cazuri). FrecvenÈ›ele alelelor de risc în Malinois se apropiau de cele din grupul de control, sugerând posibile haplotipuri protective.

Loci cu efect diferenÈ›iat în funcÈ›ie de subtip histologic

Într-un subset de cazuri cu clasificare histologică, două regiuni (CFA17:54Mb È™i CFA28:24.8Mb) au fost semnificativ asociate cu subtipul intestinal, nu însă cu cel difuz.

Loci de selecÈ›ie diferenÈ›ială între rase

Analizele între Tervuren, Sheepdog È™i Malinois au identificat:
  • Haplotipuri comune în Tervuren/Sheepdog care conÈ›in gene implicate în tumorigeneză: PLAU, FUT11, VCL, NDST2 È™i HDAC2.
  • Haplotipuri frecvente în Malinois ce par a fi protective: SOX2-OT È™i IGF2BP2, ambele cunoscute pentru rolul în reglarea expresiei genice în cancerul gastric uman.

Variante rare și funcționale

Analiza variantelor rare din regiuni critice a identificat:
  • Variante codante în CD101 (asociată cu subtipul intestinal) È™i DCLRE1A.
  • Variante reglatoare în regiuni enhancer È™i promoter umane sinergice cu gene implicate în cancer: PTEN, HDAC2, EPAS1/HIF2A.
  • Variante în HDAC2-AS2, un lncRNA ce reglează expresia HDAC2 È™i HS3ST5, identificate într-un super-enhancer activ în stomac.

Concluzii

Acest studiu demonstrează că cancerul gastric la Tervuren È™i Sheepdog este un model valoros pentru studiul geneticii cancerului gastric uman. Au fost identificate 15 loci semnificativi, inclusiv gene tumorale clasice (PTEN) È™i noi candidaÈ›i (PDZRN3, KLHL29), dar È™i haplotipuri protective implicând SOX2-OT È™i IGF2BP2.

Implicațiile studiului includ:
  • Validarea câinilor ca model translational relevant pentru cancerul gastric uman.
  • Identificarea unor È›inte terapeutice potenÈ›iale în HDAC2 È™i IGF2BP2.
  • Necesitatea studiilor funcÈ›ionale suplimentare pentru elucidarea mecanismelor de acÈ›iune ale variantelor identificate.

Acest model canin oferă o platformă unică pentru explorarea terapiilor țintite și a profilurilor genetice predictive pentru cancerul gastric.

Data actualizare: 03-06-2025 | creare: 03-06-2025 | Vizite: 147
Bibliografie
Cook, S. R., et al. (2025). Genomic analyses identify 15 risk loci and reveal HDAC2 , SOX2-OT , and IGF2BP2 in a naturally occurring canine model of gastric cancer. Proceedings of the National Academy of Sciences. https://doi.org/10.1073/pnas.2416723122

Image by wirestock on Freepik
©

Copyright ROmedic: Articolul se află sub protecția drepturilor de autor. Reproducerea, chiar și parțială, este interzisă!

Alte articole din aceeași secțiune:

Din Ghidul de sănătate v-ar putea interesa și:
  • Cum se manifestă cancerul gastric? - simptome frecvente
  • O moleculă bacteriană poate fi cheia pentru combaterea cancerului de stomac
  • Cancerul de stomac (gastric) - simptome de alarmă pentru un diagnostic timpuriu
  • Forumul ROmedic - întrebări È™i răspunsuri medicale:
    Pe forum găsiți peste 500.000 de întrebări și răspunsuri despre boli sau alte subiecte medicale. Aveți o întrebare? Primiți răspunsuri gratuite de la medici.
      intră pe forum