Studiul ADN-ului canin descoperă noi gene legate de cancerul gastric uman
©
Autor: Airinei Camelia

Cancerul gastric este a cincea cauză principală de mortalitate oncologică la nivel mondial. Adenocarcinomul gastric reprezintă 90% din cazuri, dintre care subtipul intestinal se dezvoltă în paÈ™i progresivi de la inflamaÈ›ie cronică la metaplazie È™i displazie. Helicobacter pylori este un factor de risc major pentru subtipul intestinal, dar baza genetică a formelor familiale rămâne slab înÈ›eleasă. Studii GWAS anterioare la oameni au identificat polimorfisme asociate cu riscul, însă majoritatea cazurilor sporadice rămân fără o cauză genetică cunoscută.
La câini, cancerul gastric este rar (<1%), dar apare frecvent (până la 5%) la Tervuren È™i Sheepdog, sugerând o componentă genetică puternică. IncidenÈ›a crescută în aceste rase, combinate cu gradul ridicat de omogenitate genetică, oferă o oportunitate unică de a identifica loci cu impact semnificativ în susceptibilitatea la boală.
Despre studiul actual
Cercetătorii au analizat 200 de cazuri (151 Tervuren, 49 Sheepdog) È™i 270 de controale. Vârsta medie la diagnostic a fost 9,2 ani pentru cazuri È™i 13,2 ani pentru controale. Nu s-au observat diferenÈ›e semnificative legate de sex.Analizele au inclus:
- Imputarea datelor de pe matrice SNP folosind un panou de referință WGS cuprinzând peste 1.100 de câini.
- Modelare GWAS bayesiană (BayesR), care a estimat simultan efectele a ~577.000 de variante.
- Analiza XP-nSL pentru detecția semnăturilor de selecție (homoziogozitate extinsă).
Rezultatele principale:
- 15 loci genetici au fost asociaÈ›i cu cancerul gastric, dintre care 8 au avut efect moderat (efect ≥ 0.001).
- Regiunea de cel mai mare impact a fost pe CFA20, conÈ›inând gena PDZRN3.
- Alte regiuni de interes au inclus: PTEN (CFA26), KLHL29 (CFA17), CD101 (CFA17), HDAC2 (CFA12), EPAS1/HIF2A (CFA10).
Rezultate
Loci asociați și validare
Modelul aditiv cu 15 loci a avut o capacitate predictivă internă ridicată (AUC = 0.918, 95% CI: 0.893–0.943). În cohorta independentă de validare, AUC-ul a fost de 0.636, sugerând o uÈ™oară supracalibrare în cohorta GWAS, dar susÈ›inând validitatea biologică a principalilor loci identificaÈ›i.Câinii din rasa Malinois, care sunt înrudiÈ›i genetic dar nu prezintă risc crescut, aveau un număr semnificativ mai mic de alele de risc (medie: 15.4 vs. 20.3 în cazuri). FrecvenÈ›ele alelelor de risc în Malinois se apropiau de cele din grupul de control, sugerând posibile haplotipuri protective.
Loci cu efect diferenÈ›iat în funcÈ›ie de subtip histologic
Într-un subset de cazuri cu clasificare histologică, două regiuni (CFA17:54Mb È™i CFA28:24.8Mb) au fost semnificativ asociate cu subtipul intestinal, nu însă cu cel difuz.Loci de selecÈ›ie diferenÈ›ială între rase
Analizele între Tervuren, Sheepdog È™i Malinois au identificat:- Haplotipuri comune în Tervuren/Sheepdog care conÈ›in gene implicate în tumorigeneză: PLAU, FUT11, VCL, NDST2 È™i HDAC2.
- Haplotipuri frecvente în Malinois ce par a fi protective: SOX2-OT È™i IGF2BP2, ambele cunoscute pentru rolul în reglarea expresiei genice în cancerul gastric uman.
Variante rare și funcționale
Analiza variantelor rare din regiuni critice a identificat:- Variante codante în CD101 (asociată cu subtipul intestinal) È™i DCLRE1A.
- Variante reglatoare în regiuni enhancer È™i promoter umane sinergice cu gene implicate în cancer: PTEN, HDAC2, EPAS1/HIF2A.
- Variante în HDAC2-AS2, un lncRNA ce reglează expresia HDAC2 È™i HS3ST5, identificate într-un super-enhancer activ în stomac.
Concluzii
Acest studiu demonstrează că cancerul gastric la Tervuren È™i Sheepdog este un model valoros pentru studiul geneticii cancerului gastric uman. Au fost identificate 15 loci semnificativi, inclusiv gene tumorale clasice (PTEN) È™i noi candidaÈ›i (PDZRN3, KLHL29), dar È™i haplotipuri protective implicând SOX2-OT È™i IGF2BP2.ImplicaÈ›iile studiului includ:
- Validarea câinilor ca model translational relevant pentru cancerul gastric uman.
- Identificarea unor È›inte terapeutice potenÈ›iale în HDAC2 È™i IGF2BP2.
- Necesitatea studiilor funcționale suplimentare pentru elucidarea mecanismelor de acțiune ale variantelor identificate.
Acest model canin oferă o platformă unică pentru explorarea terapiilor țintite și a profilurilor genetice predictive pentru cancerul gastric.
Data actualizare: 03-06-2025 | creare: 03-06-2025 | Vizite: 147
Bibliografie
Cook, S. R., et al. (2025). Genomic analyses identify 15 risk loci and reveal HDAC2 , SOX2-OT , and IGF2BP2 in a naturally occurring canine model of gastric cancer. Proceedings of the National Academy of Sciences. https://doi.org/10.1073/pnas.2416723122Image by wirestock on Freepik
©
Copyright ROmedic: Articolul se află sub protecția drepturilor de autor. Reproducerea, chiar și parțială, este interzisă!
Alte articole din aceeași secțiune:
- Structura genetică a Haemophilus influenzae și potențialul unui vaccin universal
- Oamenii de știință descoperă variante rare de gene care duc la o longevitate excepțională
- Punct vulnerabil ignorat în structura ADN-ului uman și implicațiile sale pentru moștenirea genetică
- Cartografierea viromului uman pentru prevenirea și tratamentul bolilor
Din Biblioteca medicală vă mai recomandăm:
Din Ghidul de sănătate v-ar putea interesa și:
Forumul ROmedic - întrebări și răspunsuri medicale:
Pe forum găsiți peste 500.000 de întrebări și răspunsuri despre boli sau alte subiecte medicale. Aveți o întrebare? Primiți răspunsuri gratuite de la medici.- Cancerul la stomac, ficatul in metastaza
- Cum putem tari fara stomac
- Metastaza peritoneala osoasa
- Cancer gastric
- Cancer la stomac faza avansata, cu metastaze la ficat
- LLC si Cancer gastric
- Cancer gastric sau ulcer? semnal de alarma?!
- Cancer gastric
- Cancer la mai multe organe.. se mai poate face ceva?
- Cancer la stomac - infromatii